如何有效率的讀期刊論文/Paper (2024 ver)

2024.09 更新：把一些新的想法放進去。然後粗淺的討論 AI 如何幫助讀Paper，將會開另一篇討論。

前言

因為又要更新下學期的教材，學生也遇到寫期刊論文(Paper; 之後都會以P來代表)初稿太口語化的問題然後需要給予幫忙，讓我決定寫一篇文章整理一下自己的方式。 怎麼讀一篇P呢？線上有很多很好的參考資料，如彭明輝老師的 大學時代的讀書方法不管用了，為什麼？ 或是Science期刊發表很多不同方式的 How to (seriously) read a scientific paper。這兩篇都很好，所以我也不想老生常談，主要是想探討怎麼更有效率地讀一篇P。

但首先，我們先來討論為什麼要讀P。

為什麼要讀Paper

先放一張圖好了。我把研究的流程簡化成下列：

Paper在整個學術界研究的循環中代表著一個整理好的輸出成果，也是你在研究過程中增進你自己學識的一個媒介。因為P有這兩個面向，也代表了要寫一篇P之前要先知道怎麼讀P。因為只有這樣，你才會知道要寫什麼（作者的角度），知道讀者多愁善感渴望的心渴求什麼？（讀者的角度）。

就是中間的框框如何更快地達成一個正面的迴圈。

好吧，我發現好像還是先講要怎麼讀懂一篇P。因為不是那麼的簡單。有時候從一篇P開始，如果是剛開始的學生，你通常需要很快地去系統化的做文獻回顧（Literature Review）:

這也是一個研究者很重要的核心能力之一。因為讀懂它，代表你的基礎能力像上圖的一座山一樣，有一定的基礎，以後讀懂相關的文獻也比較沒問題，達到獨立思考。

所以效率才是重點

完全瞭解一篇P不難，就是要花時間。但是要在很短時間收取它的精華，甚至要決定花多少時間在某篇P上，這是一個難題。舉例來說，我之前有看過學生為了要討論一篇P花了整整一個禮拜。如果對這位學生來說這篇P是完全新的領域，而花很多時間去了解這篇背後的專業背景、問題的癥結、實驗細節等等，那當然是值得的。以學習曲線來說，這是一開始對新領域不熟悉而造成掌握信息的速度變慢許多。

但是接下來要想的是，下一次讀P會花更少時間嗎？為什麼？這重要嗎？

把上圖改成要寫一篇P/論文好了：

一篇P 要引用的文獻（山頭）可能是其他30-50篇好了。那你覺得相關的理論（山腰）需要幾篇？然後這些理論的的基礎（山底）需要幾篇？當然有些可以是教課書或是已經發表的文獻回顧(Review article)可以替代的。我們假設這座山是一個正方形好了，那也要30+30+30 = 90 篇。以一個碩士來說好了，90篇花一天讀的話，那也要3個月。

看看我自己七月的行程 （用一個軟體 toggl算），先不算七月中之後出差到月底忘記算，至少在實驗室的前11天裡我花了快8 小時讀P。雖然七月真的很忙所以算是低估，但是以這樣來算的話，我一年會~260小時就是在讀P上。我算過我一年應該是要讀至少120篇P。我覺得這還算少的，如果可以的話能給我多一點時間讀會更棒。畢竟，讀自己感興趣的東西是研究工作最棒的其中一部分。

是，這很重要。主要還是時間的管理。畢竟身為一個研究者，你必須時常的去更新你的學識跟嘗試新的東西(爬第二座山），思考新的想法。其實也沒有很新，說不定都是其實是五年前的想法（五年前想到、四年前開始做、一年前投稿、Boom!）。所以懂的怎麼有效率的管理時間去更新你的想法是作為獨立的思考者非常重要的課題之一。

也許更重要的是，你也可以思考這樣你喜不喜歡這樣的生活。

最重要的是你可以從這篇文章得到什麼，然後你要訓練自己怎麼有效率地做這一件事情。

接下來這是我的方法，每個人都會有自己的習慣。希望你可以找出你的模式。

讀Ｐ的 步驟

第零步：為什麼要讀P

1. 學識的取得
2. 想法的取得或收斂
3. 讀、寫作能力的取得
4. 實驗步驟、分析的取得
5. 興趣
6. 文獻回顧 (literature review)
7. 預測領域的走向
8. 老師逼的 *
9. 世界和平

* 記得當你對自己沒有安排時，人生就會有一些雜七雜八的人幫你安排。

第一步：讀P的目的。

1. 完了下禮拜要報一篇P
2. 老師給一篇P叫你讀
3. 更新自己的腦袋/教材
4. 自己領域的新知
5. 想要了解一個新領域
6. 正在分析結果
7. 正在寫一篇文章
8. 想知道有什麼文獻可以解釋或反駁你的結果
9. 完了這篇P的標題根本就是我正在做的
10. 這篇竟然cite 了我誒好棒趕快去讀

第二步：打造一個讀P的環境跟過程。

“情境一：你在網上找到一篇P，你用最新的可線上編輯pdf 的軟體準備好好讀做很多註解，然後朋友fb 如果你有朋友的話 你，回覆訊息後發現有兩封email，讀完後發現很久沒更新的獵人竟然更新了。。一天下來，你發現你好像還沒讀完整篇P，但是至少知道了某人要讓宇宙發大財。”

這樣的情況是否相似？

古人讀書時還要紅袖添香，而現代宅宅都是穿無袖的這個時間點下，至少要想一個能讓你專心的情境。然後工欲善其事必先利其器，就算讀完了，了解這篇了，如果沒有把這些知識稍稍改變你的認知，那你終究只會多懂一點冷知識而已。

我發現很多人其實很少探討這一部分。但我覺得非常重要，就是長時間的效率問題。雖然我有一陣子也是想把所有的資料都存在線上，筆記也在線上好整理等等。後來發現太多誘惑 漫畫啊～，還是回歸學生時期演練最習慣的動作。

所以在讀的時候我會：

1. 我會印出來。
2. 然後要做筆記，所以我會準備一張白紙。
3. 放 One republic + Coldplay + Snowpatrol + Linkin Park (RIP Chester) 的歌
4. 1. 人生正面的時候會一直放 Everything I need
   2. 負面的時候會一直放 Skinny Love
5. 在讀的時候可以把重點寫在文章的第一頁
6. 在paper上畫筆記跟註解 或是滿滿的OS
7. 在讀的時候可以把重點寫在文章的第一頁
8. 在分別的白紙上寫你 a.自己的觀點、b. 得到的想法跟 c.接下來要做的。範例如下：
   1. 重點！這很有趣代表著 A -> B -> C ! 是否代表 D 也有可能? 等等要找是否有 C -> D 的文獻
   2. 這幾句寫得太漂亮了。之後寫計畫可以寫相似的
   3. 這方向對嗎？
   4. A -> B 這部分我需要找更多有關 A 的 Review
   5. 我需要讀這個通訊作者更多的P
   6. 要找學生meeting 了。~~ ~~
   7. 目前的想法

讀完好的P的話。會以不同課題個別收集。

第三步：讀的順序。

這在網路上也有很多文章，主要在這邊 How to (seriously) read a scientific paper 也有很多不同學生跟教授分享他們讀的方式跟背後的原因。我的方式為：

1. Title and abstract 先讀，決定要不要印出來讀。
2. 如果生資軟體沒有github，就謝謝指教下一篇吧
3. Figures and Conclusion
4. 緒論 Introduction *
5. Methods
6. Results
7. Discussion

註：這是比較偏生科的期刊

大部分人會建議 [3] 緒論 (Introduction) 可以最後讀，原因為如果你自己也在相似領域的話，其實你說不定已經知道大部分的文獻與要探討的問題。我把緒論放在前面 ，是因為 [1] 跟 [2] 是讓我先有對這篇P的課題有自己的想法跟角度，然後我會從緒論去嘗試了解作者們的想法跟當下的情境，互相驗證。緒論也是可以欣賞不同領域的學者怎麼寫作的戰場，在這邊是可以嘗試了解不同寫作風格/性格。不過倒是可以讀快一點。某些人也會建議 [4] Methods 可以很後面讀。我是覺得Methods 很重要因為需要知道這篇P做實驗的嚴謹度或是當下的挑戰。

有些讀者會速讀很快看一遍。覺得值得深讀會再看第二次第三次。這是 Prof. S. Keshav 所謂的三讀法，或是彭明輝老師文章講的螺旋式閱讀法。這是我以前的方式。不過有了自己筆記之後，我通常是會在分析的時候看一次，然後真正寫P的時候再重新看一次。

找尋新的想法、接觸新領域、備課、或是諸事不順的時候我會先找兩篇Review。一篇五到十年前的跟一篇最近的。然後開始從舊的開始讀。然後再從這兩篇Review有cite 的P 開始讀。主要是抓住這個領域i)嘗試解釋什麼問題 ii) 用的方法跟角度iii) 文筆 iv) 關鍵字。加上自己的角度歸納出一個想法之後嘗試搜尋是否有相關的文獻。

如果是軟體的話，讀完後會去下載試用。然後看他們的核心code。

如果是分析相關的統計的話，又對自己很重要的話，會再排一段時間去演算看看。

第三點五步：報告P的時候老師看什麼。

“情境二：你是清Ｘ的某實驗室學生。你的老師是出了名的博學，然後給了你一篇P有關一隻鳥的基因體分析要你下次報。你是第一次報，所以你問了一下這篇的重點還有要注意的重點。老師講得超快結果你只記得一兩點，全身充滿法喜但是還是不太知道要怎麼報。”

報Ｐ有兩大目的： [1] 妳自己基礎學識跟簡報能力的精進，還有 [2]分享給實驗室每一個人正確的資訊。一個實驗室如果一個禮拜有P的報告，加上自己讀的P，等於無時無刻都在收攏新的資訊。某一方面 [2]更重要，因為報錯的話等於整個實驗室收到的資訊都是錯的。

這時候老師或是實驗室比較有經驗的夥伴就很重要了。老師主要是依他的經驗當作整個報告的控管（你講得對不對 是不是在唬爛），然後給予建議，主要是報告的時候的小習慣 沒有信心的部分會不會變快變小聲，資訊傳達的精準度 我覺得他做的沒有很好但是講不出來為什麼，學識的了解。

第四步：了解一篇P的不同等級

見Ｐ是Ｐ[整篇P的來龍去脈]

1. 為什麼要讀這篇Ｐ, i.e.,你讀這篇的目的是什麼
2. 作者是誰，之前做了什麼，現在在做什麼相關研究
3. Authors contribution? 第一作者是學生還是？ #審視自己的狀況
4. 所以作者們為什麼要發表這一篇
5. 整篇Ｐ在講什麼 **
6. 結果是什麼

見Ｐ不是Ｐ [論述攻防]

1. 批判這篇的弱點。
2. 這篇什麼沒講？為什麼？
3. 有哪些實驗應該做？
4. 統計對嗎？嚴謹嗎？
5. 有哪些P作者應該引用但是沒有？

見Ｐ還是Ｐ[你自己的意見; 獨立思考]

1. 回到原點，這篇Ｐ解決了什麼問題。有改變整個領域嗎？還是少許的推動？還是學生為了要畢業？
2. 以作者群來說，他們接下來可以做什麼。 還是只是有錢
3. 其他實驗室對這篇的看法？
4. Data 有發表嗎？
5. 實驗室或是自己可以得到什麼。

** 大部分學生認為這點最重要。是沒有錯，但我說過一篇P有兩個面向（作者跟讀者）
但是報告的重要一點是你要把自己帶入作者的角色而去讀這一篇。

第五步：其他原則

1. 一個禮拜最少最少最少讀2篇 *
2. 跟學生計畫有關/給的 P 一定要讀
3. 正在寫某一個P的話每天要至少讀一到兩篇相關的P
4. 每兩個月大整理一次自己的筆記跟已經印的P。
5. 刊載在大期刊的Ｐ盡量三個禮拜讀一篇。#滿滿的Supplementary

AI 跟不同工具的幫助

先謝謝你讀到這邊。因為，這可以代表你有完整的讀完這篇文章，或是很快地找到自己想要的重點。

我把AI 的部分放在最後 (雖然可能是大部分人想讀的)，是因為我想說讀P是一個過程 (造山），而不是一個終點（我要到山頂）。但是很多人把它當作作業、報告、工作交差的解決方案（直升機直接飛到山頂？），而不是學習過程的一個輔助工具（超強挖土機？）。自己身為AI 工具的重度擁抱者，在看到現在網路上充斥著如何用工具抓一篇論文的重點 “幫自己讀論文”，我其實覺得對一開始學著要怎麼讀文獻的學生有點危險。在這個注意力跟時間都不夠用的社會，有時候花一天從頭到尾好好的讀一篇論文才是最重要的訓練。你才能跟作者做一個知識上的連結，讓自己的語言（英文）能力，了解到文章的起因跟途中可能的挑戰，而不是 “結果”跟”重點”.

AI工具是非常非常有用的，但前提是要建立在你已經有你自己對一些課題的品味。不然你怎麼知道這些重點哪些是對的還是錯的呢？還是多精準呢？ 而自己寫論文的前提是讀懂這些論文背後的意義。如果一開始也是利用 AI “幫自己寫論文”, 那永遠都是一個似懂非懂的狀態，如果指導者沒有適時（或是有能力）點出的話，那只是在網路上充斥更多文字的順序排列而已，如下圖 😅

這其實也沒錯，因為老實說，很多事情的目的其實就是交差了事就好。一定有一群老師不想教學生，一定也有一群學生只想拿文憑，AI 的工具只是放大這個現象而已。

如果回到基本面，用AI來幫助你的話，關鍵在於如何把AI當成輔助工具，而不是依賴它代替自己的思考。最好的使用方法，是將AI工具當作一種補充、引導的角色，幫助你在已經建立的知識基礎上，更快地找到有價值的資訊或分析角度。實際來說，分幾個面向：

1. 如何更快速了解一篇Paper . 學生通常拿到一篇P會直接翻譯 🥹，然後解釋每一句的意思。不懂的時候，也許可以叫AI 嘗試用不同的方式解釋。之前在youtube看到用chatgpt4有一個好的範例, 問題是簡單的根本不需要，難的你可能還是慢慢用原文讀才比較能確定。

2. 文獻回顧。這算是上一點的延伸。例如，當你在讀一篇文獻時，AI可以幫你快速過濾出相關的關鍵詞，或總結文章的結構，甚至能幫助你進行交叉比對，找到其他可能有關聯的文獻。然而，這一切還是需要在你已經具備基礎理解的前提下進行的。換句話說，AI不是替代，而是輔助。它可以幫你更快速地到達目的地，但你仍然需要決定要去的方向，了解如何判斷正確的路線。

3. 提升效率。這篇的重點。在研究的過程中，許多學生和研究者面臨的最大挑戰是大量的文獻和資訊。AI工具能夠幫助我們減少繁瑣的手工篩選，將時間和精力集中在更具創造性和深入思考的部分。然而，若只是單純依賴AI自動生成的摘要或重點，卻忽略了自己的獨立思考，那麼這種依賴只會削弱我們對知識的掌控力。當你花三小時去嘗試用一個軟體的時候，不如回到原點更新自己一下。

4. 輸出。AI 不僅能幫助你在文獻閱讀的過程中節省時間，還能在你整理思路、撰寫論文時提供支持。例如，AI 可以幫助你在寫作時生成初步的文本框架，協助你進行語法校正或釐清段落結構，使你能夠更專注於內容的深度思考與邏輯推演。然而，AI生成的內容應該僅作為一個參考或輔助，最終的語言風格和觀點必須是你自己建構的。過度依賴AI寫作可能會導致論文風格缺乏個性或深度，甚至影響學術誠信。因此，AI 是一個強大的輔助工具，但論文的核心思想必須源於作者自己的思考與學術素養。這可能之後寫一篇來討論。

老實說，以網路上大部分使用者分享來說，都是完全不懂一個領域然後要達到一個速成有一些概念 的階段. 這通常是媒體工作者，KOL，或是要以某個目的趕快可以達到網路聲量 / 交差的方式。也許是一個短片, 也許是一個報告. 但這些使用方式對剛開始嘗試建立自己研究流程的學生或已經走在很前面的領導者來說，是不適用的。

不同的面向需要用不同的介面。以我自己整理的方式來說， Google 最近出的 notebooklm 我還蠻喜歡的，期待某一天它跟google scholar 整合起來。總結來說，AI的力量取決於使用者的思維深度。如果我們有扎實的知識基礎，能有效利用 AI 工具來提升學術效率，便能在文獻閱讀、論文撰寫以及知識吸收上取得巨大的進步。而如果僅僅依賴AI代勞，那麼在這個資訊過剩的時代，我們會逐漸失去對知識的主導權與創造力。所以，與其讓AI取代思考，不如讓它成為我們的學習夥伴，助我們登上更高的知識高峰。

後續？

怎麼算讀進去一篇P呢？

讀很多P可以提升你的眼見，想法等等。

但是只有開始嘗試相關的實驗或是分析相關的資料，變成或改變自己的想法有收斂、整合，之後增加自己或是實驗室整體的能力，才算是真正讀一篇P 進去。就就差沒刻進去了

在傳統的學術研究中，最終的成果就是論文發表。

你自己發表文章時撰寫的緒論和文獻回顧，往往是對該領域最好的整理和概述。

經過這一過程，之前整理的筆記和印出的相關文獻，都可以被你自己的這篇論文所替代，成為你在該課題上的總結與深化。

然後之前整理有關這個課題的筆記、印的P就可以用這篇替代了。

又一個里程碑

希望對大家有幫助。學會了怎麼讀，就可以開始想怎麼寫了。

References

1. icon source